Lecteur de fichiers de maillage au format msh
.
Plus de détails...
Classes | |
struct | MshElementBlock |
Infos d'un bloc pour $Elements pour la version 4. Plus de détails... | |
class | MshItemKindInfo |
Informations pour créer les entités d'un genre. Plus de détails... | |
class | MshMeshAllocateInfo |
Informations pour créer les entités Arcane. Plus de détails... | |
struct | MshNodeBlock |
Infos d'un bloc pour $Nodes. Plus de détails... | |
class | MshToArcaneTypeInfo |
Informations de correspondance entre le type MSH et le type Arcane. Plus de détails... | |
Fonctions membres publiques | |
MshParallelMeshReader (ITraceMng *tm) | |
eReturnType | readMeshFromMshFile (IMesh *mesh, const String &filename, bool use_internal_partition) override |
Lit le maillage contenu dans le fichier filename et le construit dans mesh. | |
![]() | |
TraceAccessor (ITraceMng *m) | |
Construit un accesseur via le gestionnaire de trace m. | |
TraceAccessor (const TraceAccessor &rhs) | |
Constructeur par recopie. | |
TraceAccessor & | operator= (const TraceAccessor &rhs) |
Opérateur de recopie. | |
virtual | ~TraceAccessor () |
Libère les ressources. | |
ITraceMng * | traceMng () const |
Gestionnaire de trace. | |
TraceMessage | info () const |
Flot pour un message d'information. | |
TraceMessage | pinfo () const |
Flot pour un message d'information en parallèle. | |
TraceMessage | info (char category) const |
Flot pour un message d'information d'une catégorie donnée. | |
TraceMessage | pinfo (char category) const |
Flot pour un message d'information parallèle d'une catégorie donnée. | |
TraceMessage | info (bool v) const |
Flot pour un message d'information. | |
TraceMessage | warning () const |
Flot pour un message d'avertissement. | |
TraceMessage | pwarning () const |
TraceMessage | error () const |
Flot pour un message d'erreur. | |
TraceMessage | perror () const |
TraceMessage | log () const |
Flot pour un message de log. | |
TraceMessage | plog () const |
Flot pour un message de log. | |
TraceMessage | logdate () const |
Flot pour un message de log précédé de la date. | |
TraceMessage | fatal () const |
Flot pour un message d'erreur fatale. | |
TraceMessage | pfatal () const |
Flot pour un message d'erreur fatale en parallèle. | |
TraceMessageDbg | debug (Trace::eDebugLevel=Trace::Medium) const |
Flot pour un message de debug. | |
Trace::eDebugLevel | configDbgLevel () const |
Niveau debug du fichier de configuration. | |
TraceMessage | info (Int32 verbose_level) const |
Flot pour un message d'information d'un niveau donné | |
TraceMessage | linfo () const |
Flot pour un message d'information avec le niveau d'information local à cette instance. | |
TraceMessage | linfo (Int32 relative_level) const |
Flot pour un message d'information avec le niveau d'information local à cette instance. | |
void | fatalMessage (const StandaloneTraceMessage &o) const |
Fonctions membres privées | |
void | _readNodesFromFile () |
Lecture des noeuds du maillage. | |
void | _readNodesOneEntity (MshNodeBlock &node_block) |
Integer | _readElementsFromFile () |
Lecture des éléments (mailles,faces,...) | |
void | _readMeshFromFile () |
void | _setNodesCoordinates () |
Positionne les coordonnées des noeuds. | |
void | _allocateCells () |
void | _allocateGroups () |
void | _addFaceGroup (MshElementBlock &block, const String &group_name) |
Ajoute des faces au groupe group_name. | |
void | _addFaceGroupOnePart (ConstArrayView< Int64 > connectivities, Int32 item_nb_node, const String &group_name, Int32 block_index) |
void | _addCellOrNodeGroup (ArrayView< Int64 > block_uids, Int32 block_index, const String &group_name, IItemFamily *family, bool filter_invalid) |
Ajoute des mailles ou noeuds au groupe group_name. | |
void | _addCellOrNodeGroupOnePart (ConstArrayView< Int64 > uids, const String &group_name, Int32 block_index, IItemFamily *family, bool filter_invalid) |
void | _readPhysicalNames () |
void | _readEntities () |
Lecture des entités. | |
void | _readPeriodic () |
Lecture des informations périodiques. | |
void | _readOneEntity (Int32 entity_dim, Int32 entity_index_in_dim) |
bool | _getIsEndOfFileAndBroadcast () |
Retourne true si on est à la fin du fichier. | |
String | _getNextLineAndBroadcast () |
Lis la valeur de la prochaine ligne et la broadcast aux autres rangs. | |
Int32 | _getIntegerAndBroadcast () |
Int64 | _getInt64AndBroadcast () |
void | _getInt64ArrayAndBroadcast (ArrayView< Int64 > values) |
void | _getInt32ArrayAndBroadcast (ArrayView< Int32 > values) |
void | _getDoubleArrayAndBroadcast (ArrayView< double > values) |
void | _readOneElementBlock (MshElementBlock &block) |
Lit un bloc d'entité de type 'Element'. | |
void | _computeNodesPartition () |
void | _computeOwnItems (MshElementBlock &block, MshItemKindInfo &item_kind_info, bool is_generate_uid) |
Real3 | _getReal3 () |
Int32 | _getInt32 () |
Int64 | _getInt64 () |
void | _goToNextLine () |
void | _readAndCheck (const String &expected_value) |
Tente de lire la valeur value. | |
void | _addMshTypeInfo (Int32 msh_type, ItemTypeId arcane_type, ConstArrayView< Int16 > reorder_infos={}) |
const MshToArcaneTypeInfo & | mshToArcaneTypeInfo (Int32 msh_type) const |
void | _initTypes () |
Attributs privés | |
IMesh * | m_mesh = nullptr |
IParallelMng * | m_parallel_mng = nullptr |
Int32 | m_master_io_rank = A_NULL_RANK |
bool | m_is_parallel = false |
Ref< IosFile > | m_ios_file |
impl::MshMeshGenerationInfo * | m_mesh_info = nullptr |
MshMeshAllocateInfo | m_mesh_allocate_info |
Int32 | m_nb_part = 4 |
Nombre de partitions pour la lecture des noeuds et blocs. | |
UniqueArray< Int32 > | m_parts_rank |
Liste des rangs qui participent à la conservation des données. | |
bool | m_is_binary = false |
Vrai si le format est binaire. | |
UniqueArray< MshToArcaneTypeInfo > | m_msh_to_arcane_type_infos |
Informations de conversion entre les types MSH et Arcane pour les entités. | |
Int32 | m_verbosity_level = 0 |
Niveau de verbosité | |
Membres hérités additionnels | |
![]() | |
void | _setLocalVerboseLevel (Int32 v) |
Int32 | _localVerboseLevel () const |
Lecteur de fichiers de maillage au format msh
.
Le format msh
est celui utilisé par la bibliothèque gmsh.
Le lecteur supporte la version 4.1
de ce format.
Actuellement, les balises suivantes sont gérées:
$PhysicalNames
$Entities
$Nodes
$Elements
$Periodic
(en cours) Définition à la ligne 81 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
using Arcane::MshParallelMeshReader::eReturnType = typename IMeshReader::eReturnType |
Définition à la ligne 95 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
using Arcane::MshParallelMeshReader::MshEntitiesNodes = impl::MshMeshGenerationInfo::MshEntitiesNodes |
Définition à la ligne 88 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
using Arcane::MshParallelMeshReader::MshEntitiesWithNodes = impl::MshMeshGenerationInfo::MshEntitiesWithNodes |
Définition à la ligne 89 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Définition à la ligne 91 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
using Arcane::MshParallelMeshReader::MshPeriodicOneInfo = impl::MshMeshGenerationInfo::MshPeriodicOneInfo |
Définition à la ligne 90 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Définition à la ligne 87 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
explicit |
Définition à la ligne 293 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Ajoute des mailles ou noeuds au groupe group_name.
Définition à la ligne 1398 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références m_parts_rank.
|
private |
Définition à la ligne 1414 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Ajoute des faces au groupe group_name.
Définition à la ligne 1296 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références Arcane::MshParallelMeshReader::MshElementBlock::connectivities, Arcane::MshParallelMeshReader::MshElementBlock::index, Arcane::MshParallelMeshReader::MshElementBlock::item_nb_node, m_parts_rank, et Arcane::Array< DataType >::view().
|
private |
Définition à la ligne 1312 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 1878 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 1183 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 1205 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Rank auquel appartient les noeuds de ma partie.
Définition à la ligne 510 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références Arcane::TraceAccessor::info(), Arcane::math::isNearlyEqual(), m_nb_part, m_parts_rank, Arcane::math::max(), Arcane::math::min(), Arcane::IParallelMng::reduce(), Arcane::MessagePassing::ReduceMax, Arcane::MessagePassing::ReduceMin, Arcane::MessagePassing::ReduceSum, et Arcane::Real3POD::x.
Référencé par _readNodesFromFile().
|
private |
Définition à la ligne 1060 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 427 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 468 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Définition à la ligne 407 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 484 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 371 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Définition à la ligne 387 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Retourne true si on est à la fin du fichier.
Définition à la ligne 332 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références Arcane::TraceAccessor::info().
|
private |
Lis la valeur de la prochaine ligne et la broadcast aux autres rangs.
Définition à la ligne 310 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références Arcane::TraceAccessor::info().
Référencé par _readAndCheck(), _readPeriodic(), et readMeshFromMshFile().
|
private |
Définition à la ligne 447 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 500 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 1851 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Tente de lire la valeur value.
Définition à la ligne 1715 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références _getNextLineAndBroadcast(), ARCANE_FATAL, Arcane::String::bytes(), Arcane::TraceAccessor::info(), m_is_binary, Arcane::SpanImpl< T, SizeType, Extent, MinValue >::size(), Arcane::FixedArray< T, NbElement >::span(), et Arcane::CheckedConvert::toInt32().
Référencé par _readEntities().
|
private |
Lecture des éléments (mailles,faces,...)
Voici la description du format:
* $Elements * numEntityBlocks(size_t) numElements(size_t) * minElementTag(size_t) maxElementTag(size_t) * entityDim(int) entityTag(int) elementType(int; see below) * numElementsInBlock(size_t) * elementTag(size_t) nodeTag(size_t) ... * ... * ... * $EndElements *
Dans la version 4, les éléments sont rangés par genre (eItemKind). Chaque bloc d'entité peut-être de dimension différente Il n'y a pas de dimension associé au maillage. On considère donc que la dimension du maillage est la dimension la plus élevée des blocs qu'on lit. Cela signifie aussi qu'on est obligé de lire tous les blocs avant de pouvoir connaitre la dimension du maillage.
En parallèle, chaque bloc est distribué sur les rangs de m_parts_rank.
Définition à la ligne 857 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références _readOneElementBlock(), ARCANE_FATAL, ARCANE_THROW, Arcane::TraceAccessor::info(), Arcane::ItemTypeInfo::itemTypeId(), m_is_binary, m_verbosity_level, Arcane::math::max(), Arcane::ItemTypeInfo::nbLocalNode(), Arcane::Array< DataType >::resize(), Arcane::ItemTypeMng::typeFromId(), Arcane::ItemTypeInfo::typeName(), et Arcane::FixedArray< T, NbElement >::view().
|
private |
Lecture des entités.
Le format est:
* $Entities * numPoints(size_t) numCurves(size_t) * numSurfaces(size_t) numVolumes(size_t) * pointTag(int) X(double) Y(double) Z(double) * numPhysicalTags(size_t) physicalTag(int) ... * ... * curveTag(int) minX(double) minY(double) minZ(double) * maxX(double) maxY(double) maxZ(double) * numPhysicalTags(size_t) physicalTag(int) ... * numBoundingPoints(size_t) pointTag(int) ... * ... * surfaceTag(int) minX(double) minY(double) minZ(double) * maxX(double) maxY(double) maxZ(double) * numPhysicalTags(size_t) physicalTag(int) ... * numBoundingCurves(size_t) curveTag(int) ... * ... * volumeTag(int) minX(double) minY(double) minZ(double) * maxX(double) maxY(double) maxZ(double) * numPhysicalTags(size_t) physicalTag(int) ... * numBoundngSurfaces(size_t) surfaceTag(int) ... * ... * $EndEntities *
Définition à la ligne 1518 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références _readAndCheck(), ARCANE_FATAL, Arcane::TraceAccessor::info(), m_is_binary, m_verbosity_level, et Arcane::FixedArray< T, NbElement >::view().
|
private |
Définition à la ligne 1749 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Lecture des noeuds du maillage.
Lit les uniqueId() des noeuds et les coordonnées associées.
Le format est le suivant:
Définition à la ligne 588 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références _computeNodesPartition(), ARCANE_THROW, Arcane::MshParallelMeshReader::MshNodeBlock::index, Arcane::TraceAccessor::info(), m_is_binary, m_nb_part, Arcane::Array< DataType >::resize(), et Arcane::FixedArray< T, NbElement >::view().
|
private |
Définition à la ligne 630 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Lit un bloc d'entité de type 'Element'.
Définition à la ligne 753 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références Arcane::Array< DataType >::addRange(), Arcane::IParallelMng::commRank(), Arcane::MshParallelMeshReader::MshElementBlock::connectivities, Arcane::TraceAccessor::info(), Arcane::MshParallelMeshReader::MshElementBlock::item_nb_node, m_is_binary, m_nb_part, m_parts_rank, m_verbosity_level, Arcane::MshParallelMeshReader::MshElementBlock::nb_entity, Arcane::IParallelMng::recv(), Arcane::Array< DataType >::resize(), et Arcane::Array< DataType >::view().
Référencé par _readElementsFromFile().
|
private |
Définition à la ligne 1575 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Lecture des informations périodiques.
Le format est:
* $Periodic * numPeriodicLinks(size_t) * entityDim(int) entityTag(int) entityTagMaster(int) * numAffine(size_t) value(double) ... * numCorrespondingNodes(size_t) * nodeTag(size_t) nodeTagMaster(size_t) * ... * ... * $EndPeriodic *
Définition à la ligne 1665 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références _getNextLineAndBroadcast(), ARCANE_FATAL, Arcane::TraceAccessor::info(), Arcane::impl::MshMeshGenerationInfo::MshPeriodicOneInfo::m_affine_values, Arcane::impl::MshMeshGenerationInfo::MshPeriodicOneInfo::m_corresponding_nodes, m_verbosity_level, Arcane::Array< DataType >::resize(), Arccore::Array< DataType >::resize(), Arcane::CheckedConvert::toInt32(), et Arcane::FixedArray< T, NbElement >::view().
|
private |
Définition à la ligne 1454 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Positionne les coordonnées des noeuds.
La liste est répartie sur les processeurs des rangs de m_parts_rank. On boucle sur les rangs de cette liste et chaque rang envoie aux autres la liste des coordonnées des noeuds qu'il contient. Chaque rang regarde si des noeuds de cette liste lui appartiennent et si c'est le cas positionnent les coordonnées.
Définition à la ligne 1149 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références Arcane::IItemFamily::itemsUniqueIdToLocalId(), m_parts_rank, Arcane::Array< DataType >::resize(), et Arcane::ConstArrayView< T >::size().
|
private |
Définition à la ligne 1893 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
overridevirtual |
Lit le maillage contenu dans le fichier filename et le construit dans mesh.
Implémente Arcane::IMshMeshReader.
Définition à la ligne 1909 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Références _getNextLineAndBroadcast(), Arcane::IParallelMng::commSize(), Arcane::TraceAccessor::error(), Arcane::TraceAccessor::info(), Arcane::platform::isFileReadable(), Arcane::IParallelMng::isMasterIO(), Arcane::IParallelMng::isParallel(), Arcane::String::localstr(), m_nb_part, m_parts_rank, Arcane::makeRef(), Arcane::IParallelMng::masterIORank(), Arcane::IMeshReader::RTError, Arcane::IMeshReader::RTOk, Arcane::IParallelMng::sequentialParallelMng(), et Arcane::FixedArray< T, NbElement >::view().
Définition à la ligne 210 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Vrai si le format est binaire.
Définition à la ligne 218 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Référencé par _readAndCheck(), _readElementsFromFile(), _readEntities(), _readNodesFromFile(), et _readOneElementBlock().
|
private |
Définition à la ligne 209 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 208 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 206 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 212 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Définition à la ligne 211 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Informations de conversion entre les types MSH et Arcane pour les entités.
Définition à la ligne 220 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Nombre de partitions pour la lecture des noeuds et blocs.
Définition à la ligne 214 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Référencé par _computeNodesPartition(), _readNodesFromFile(), _readOneElementBlock(), et readMeshFromMshFile().
|
private |
Définition à la ligne 207 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
|
private |
Liste des rangs qui participent à la conservation des données.
Définition à la ligne 216 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Référencé par _addCellOrNodeGroup(), _addFaceGroup(), _computeNodesPartition(), _readOneElementBlock(), _setNodesCoordinates(), et readMeshFromMshFile().
|
private |
Niveau de verbosité
Définition à la ligne 222 du fichier MshParallelMeshReader.cc.
Référencé par _readElementsFromFile(), _readEntities(), _readOneElementBlock(), et _readPeriodic().